بررسی تنوع ژنتیکی گیاه دارویی پنج‌انگشت (Vitex agnus-castus L) بر اساس نشانگر مولکولی ISSR

نوع مقاله : مقاله علمی - پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد رشته زیست‌شناسی، دانشگاه پیام نور ، واحد کرمانشاه

2 استادیار، گروه زیست‌شناسی، دانشگاه پیام نور، واحد کرمانشاه

3 دانشیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، واحد کرمانشاه (farshadfarmohsen@yahoo.com)

4 کارشناس ارشد گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، واحد کرمانشاه

چکیده

DOR:
98.1000/1735-0891.1398.27.179.54.2.1576.82
گیاه پنج‌انگشت یکی از مهمترین گیاهان دارویی است که نقش مهمی در سلامت زنان دارد. با توجه به تنوع بالا بین نمونه‌های این گیاه، تنوع ژنتیکی تعداد 19 ژنوتیپ با استفاده از 13 آغازگر ISSR بررسی شد. آغازگرهای ISSR درمجموع توانستند 74 باند تولید کنند که از این تعداد، 4 باند یک‌شکل و مابقی چند شکل بودند. میانگین درصد چندشکلی در بین ژنوتیپ­های مورد بررسی برابر 95% بود که درصد چندشکلی برای آغازگرهای UBC824 (80%)، IS14 (83%)، UBC851 (83%) و IS11 (89%) و برای سایر آغازگرها برابر با 100% بود. در مجموع بر اساس کلیه شاخص‌ها، مناسب‌ترین آغازگرها برای بررسی تنوع ژنتیکی پنج‌انگشت، آغازگرهای IS16، IS5 و UBC807 معرفی شدند. فاصله ژنتیکی ژنوتیپ­های مورد بررسی با استفاده از ضریب دایس از 195/0 تا 593/0 متغیر بود. نتایج حاصل از دندروگرام تجزیه خوشه‌ای به روش UPGMA بر اساس ضرایب فاصله دایس، ژنوتیپ‌ها را در 3 گروه قرار داد. ژنوتیپ­ها بر اساس روش تجزیه به مختصات اصلی اول و دوم پراکنش داده شدند که این دیاگرام با نتایج تجزیه خوشه­ای کاملاً مطابقت داشت. همچنین نتایج حاصل از گروه­بندی‌ها، با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی تأیید شد.
 

کلیدواژه‌ها

موضوعات


-  Ahmadi, M., S., M., Kaffi, M., Whitecane, F., Melkzadeh Shahareti, S. 2016. Valuation of genetic diversity in several populations of medicinal plant Nowruzak (Salvia leriifolia) using ISSR markers. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research 23(1): 1-12.
-  Altıntas, S., Toklu, F., Kafkas, S., Kilian, B., Brandolini, A. and zkan, H.O. 2008. Estimating Genetic Diversity in Durum and Bread Wheat Cultivars from Turkey Using AFLP and SAMPL Markers. Plant Breeding, 127: 9-14.
-  Biabani, Kh. 2016, A study on the genetic diversity of thyme populations in the Boyer Ahmad cold region using the ISSR molecular marker and features of appearance, Yasouj University, Iran (In Persiam).
-  Donald, J. and Brown, N.D., 1994. Vitex agnus castus, Clinical Monograph. Experimental Gerontology. 29 (3-4): 319-321.
-  Farshadfar, M., Kissimon, T. and Sutka. J. 1995. Genetic distance between Triticum timopheery zhuk, T. araraticum Jakubz, Plant Breeding, 114: 401-405.
-  Gravand, T. 2012. Investigation of intrinsic and interspecific genetic variation in Iranian pepper masses using ISSR molecular marker, Master's thesis, Plant Breeding, Isfahan University of Technology, Faculty of Agriculture.
-  Gupta, P.K. 1996. Cytogenetic. Rastogi publication. Shvaji Road. Meerut-250002, India
-  Hou, Y., Yan, Z. and Wei, Y., 2005. Genetic diversity in barely from west China based on RAPD and ISSR analysis Barely. Genetics Newsletter, 35:9-22.
-  Kayis, S. A., Hakki, E. E., and Pinarkara, E. 2010. Comparison of effectiveness of ISSR and RAPD markers in genetic characterization of seized marijuana (Cannabis sativa L.) in Turkey. African Journal of Agricultural Research, 5 (21): 2925-2933.
-  Kumar, M., Mishra, G P., Singh, R., Kumar, J., Naik, P K. and Singh, Sh B., 2009. correspondence of ISSR and RAPD markers for comparative analysis of genetic diversity among different apricot genotypes from cold arid deserts of Trans-Himalayas. physiology and Molecular Biology of Plants, 15(3): 225-236.
-  Milbourne, D., Meyer, R., Bradshaw, J. E., Baird, E., Bonar, N., Provan, J., Powell, W. and Waugh, R. 1997. Comparison of PCR-based marker systems for the analysis of genetic relationships in cultivated potato. Molecular Breeding, 3: 127–136.
-  Mohammadi, S A. and Prasanna, B M., 2003. Analysis of genetic diversity in crop plant: Salient statistical tools and considerations. Crop Science, 43: 1235-1248.
-  Nikkerdar, F., Farshadfar, M., Ebrahimi, M., Shirvani, H., 2015. Evaluation of the efficiency of SCOT molecular marker in assessing the genetic diversity of fennel herb. Journal of Crop Breeding. 24(4): 95-102
-  Palmer, E. and Pitman, N. 1972. Tree of Southern Africa, Covering all known indigenous species in the Republic of South Africa, South- West Africa
-  Peters, J.P. and Martinelli، J.A. 1989. Hierarchical cluster analysis as a tool manages variation in germplasm collection. Theoretical and Applied Genetics 78: 42-48
-  Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingey, S. and Rafalski, A., 1996. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Molecular Breeding, 2: 225-238.
-  Rahim Malek, M., 2011. Study of genetic relationships of some species of mint using the R_ISSR marker. Journal of Biotechnology in Agriculture. 10(1): 11-17
-  Thimmappaiah, W., Santhosh, G., Shobha, D., and Melwyn, GS. 2008. Assessment of genetic diversity in cashew germplasm using RAPD and ISSR markers. Sciatica Horticulture, 118: 1-7.
-  Torres, AM., Weeden, NF. and Martin, A., 1993. Linkage among isozyme, RFLP and RAPD markers in Vicia faba. Theoretical and Applied Genetics, 85: 935–945.
-  Zanganeh, K., Fakheri, B., Aruji, F., Afzali Far, A., Makhdoomi, M., A. 2017. Study of genetic diversity of ecotypes of Forniculum Gulgare Mill in Iran using Molecular ISSR. Journal of Biotechnology of Medicinal Plants, 2(4):10-19
-  Ziaee, A., Mesgarpour, B., Shabestari, A. 2008. The Caution of Drug Use and Drug Interactions Based on Evidence and Documentation. Publications Taimorzadeh, Tehran, 466 pages.
-  Sarla, N., Mallikarjuna Swamy, BP., Sudhakar, T., Prasad Babu, A., Kaladhar, K., Surendhar Reddy, C., Ashok Reddy, G., Ramesha, MS., Shobha Rani, N. & Viraktamath .(2009. High yielding rice lines from elite × wild crosses. Directorate of Rice Research, Newsletter, 7(2):15-21.