TY - JOUR ID - 116636 TI - جداسازی و مطالعه بیوانفورماتیکی ژن عامل رونویسی TbJAMYC دخیل در بیوسنتز تاکسول از سرخدار گونه ایرانی JO - تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران JA - IJRFPBGR LA - fa SN - 1735-0891 AU - جعفری, داود AU - دهقان نیری, فاطمه AD - دانشجوی دکتری تخصصی بیوتکنولوژی پزشکی، گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران AD - نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بین‌المللی امام خمینی، قزوین پست الکترونیک: nayeri@alumni.ut.ac.ir Y1 - 2018 PY - 2018 VL - 26 IS - 1 SP - 12 EP - 22 KW - تجزیه‌وتحلیل‎ بیوانفورماتیکی KW - تاکسول KW - bHLH KW - سرخدار KW - عامل رونویسی MYC DO - 10.22092/ijrfpbgr.2018.116636 N2 - داروی ضد سرطان تاکسول یا پاکلی­تاکسل از متابولیت­های بیوسنتز شده در سرخدار (Taxus bacatta) است. تاکسول یکی از مهمترین و کاربردی­ترین داروهای ضد سرطان در درمان سرطان ریه است که با جلوگیری از پلیمریزاسیون میکروتوبول­ها مانع از تقسیم سلولی در بافت­های سرطانی می­شود. عامل رونویسی JAMYC از خانواده MYC دارای موتیف متصل­شونده به DNA به‎نام bHLH می­باشد که در سایر گونه­های سرخدار شناسایی شده است. هدف از این تحقیق جداسازی و همسانه­سازی ژن عامل رونویسی TbJAMYC برای اولین بار و تجزیه‌وتحلیل بیوانفورماتیکی آن است. در ابتدا برای به‎دست آوردن گیاهچه­های این گیاه رویان از دانه­های این گیاه خارج و در محیط کشت MS حاوی زغال فعال و اسیداسکوربیک کشت شد. از RNA استخراج شده با کیفیت و کمیت خوب cDNA سنتز شد. ژن عامل رونویسی TbJAMYC به‎وسیله PCR از cDNA و آغازگرهای اختصاصی این ژن تکثیر شد. قطعه تکثیر شده در ناقل همسانه­سازی pTG 19  به‎روش TA کلونینگ همسانه­سازی و توالی­یابی شد. خانواده پروتئینی و دمین­های پروتئین TbJAMYC به‎وسیله نرم­افزار Pfam تعیین شدند. همچنین به‎وسیله نرم­افزار Modeller ساختار سه بعدی دمین­‏های متصل شونده به DNA این پروتئین تجزیه‌وتحلیل و مدل­سازی شد. این تجزیه‌وتحلیل‎ها نشان دادند که پروتئین TbJAMYC جزء عوامل رونویسی MYC حاوی دمین bHLH برای اتصال به DNA و تنظیم بیان ژن­ها می­باشد. UR - https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_116636.html L1 - https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_116636_0565edd04cd8b9286b4027e4ebd4381a.pdf ER -