مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Identification of miRNAs and their target genes in red clover (Trifolium pretense)شناسایی miRNAها و ژنهای هدف مرتبط با آنها در گیاه شبدر قرمز (Trifolium pratense)15616411795410.22092/ijrfpbgr.2018.117954FAمحمد رضا نقوینویسنده و مسئول مکاتبات، استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
mnaghavi@ut.ac.ir : پست الکترونیکعلی اکبر کریمیدانشجوی کارشناسی ارشد، بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایرانJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.155.52.26.1588.41
<br />MicroRNAs (miRNAs) are a group of 18_22 nucleotides long noncoding small endogenous<br />that derived from its precursor sequence and evolutionary conserved post-transcriptional<br />regulatory RNAs, which show an enormous role in various biological and metabolic processes<br />in both animals and plants. MiRNA detection methods including microarray, qRT-PCR ,<br />northern blot and bioinformatics methods in which the easiest and cheapest way to identify<br />miRNA is bioinformatics method. A bioinformatics approach was used to identify potential<br />miRNA in red clover. EST-based homology search was applied to find potential miRNA of red<br />clover. We blasted publicly available EST sequences obtained from NCBI GenBank against<br />previously known plant miRNAs. A total of six miRNA target genes based on their<br />complementary sequences were also detected. Target genes encoding mono dehydro ascorbate<br />reductase 1 play an important role in maintaining balance in the cycle of reactive oxygen<br />species ascorbate-glutathione, FES1 proteins that contain zinc finger domain binding DNA,<br />RHF2A gene encoding E3 ubiquitin-protein ligase involved in the positive regulation of the<br />gametogenesis progression, RNA helicase ATP-dependent is involved in the RNA repair and<br />metabolism, Major facilitator superfamily (MFS) is a superfamily of membrane transport<br />proteins that facilitate movement of small solutes across cell membranes in response to<br />chemiosmotic gradients, AT-hook DNA binding motif protein.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.155.52.26.1588.41
<br /> میکروآرناها (miRNA) یک رده از RNAهای تنظیمکننده کوچک درونی و غیرکدکننده پروتئینی که متشکل از حدود 18-22 نوکلئوتید بوده و تنظیم بیان ژن را در سطح رونویسی و پس از رونویسی ژن بر عهده دارند و طبق تحقیقات انجام شده نقشهای اساسی در فرایندهای نموی، زمان گلدهی و پاسخ به تنشهای زیستی و غیرزیستی ایفا میکنند. تاکنون روشهای متفاوتی برای شناسایی miRNAها، معرفی شده است که عبارتند از: روش نورترن بلات، ریزآرایه، qRT-PCR و روشهای بیوانفورماتیکی. در این میان سادهترین و کمهزینهترین روش شناسایی miRNAها، روش بیوانفورماتیکی میباشد. در این مطالعه با یک رویکرد بیوانفورماتیکی با هدف شناسایی miRNA متمایز در گیاه شبدر قرمز مبتنی بر جستجوی همولوژی بین ESTهای گیاه شبدر قرمز و miRNAها انجام شد. بهطوریکه ابتدا در آن همه توالیهای ESTهای گیاه شبدر قرمز از بانک اطلاعاتی NCBI در برابر miRNAهای شناخته شده BLASTn شدند که در نهایت یک miRNA کاندید متمایز در گیاه شبدر قرمزشناسایی شد. در مجموع شش ژن هدف پیشبینی شده برای این miRNA نیز شناسایی شد و این ژنهای هدف عمدتا کدکننده مونود هیدرو اسکوربات ردوکتاز1 ) برقراری تعادل گونههای فعال اکسیژن در چرخه اسکوربات-گلوتاتیون(، پروتئین FES1 )یک پروتئین حاوی دومین انگشت روی چسبنده به DNA)، پروتئین RHF2A )یوبی کوئیتین لیگاز E3 دخیل در پیشبرد گامتوژنز(، RNA هلیکاز وابسته به ATP )تعمیر و متابولیسم RNA)، پروتئینهای انتقالی MFS )تسهیلکننده حرکت املاح کوچک از عرض غشای سلولی در پاسخ به گرادیانت شیمواسمزی( و در نهایت پروتئین AT-hook )یک موتیف متصل شونده به (DNA نیز بودند.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117954_41604d4dcb5b96f364a70df8e6f6185c.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Isolation, characterization and expression analysis of 3-hydroxy-N-methylcoclaurine 4′–methyltransferase (4'OMT2) gene in Papaver somniferum L.جداسازی، تعیین خصوصیت و تحلیل بیان ژن 4’OMT2 گیاه دارویی شقایق16517611795610.22092/ijrfpbgr.2018.117956FAسید محسن سهرابیدانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآباداحمد اسماعیلینویسنده مسئول مکاتبات، دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآباد پست الکترونیک: ismaili.a@lu.ac.irفرهاد نظریان فیروزآبادیاستاد، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآبادکامران سمیعیدانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآبادJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.165.52.26.1580.32
<br />Poppy (Papaver somniferum L.) is one of the oldest medicinal plant in the world. It produces<br />several important narcotic benzylisoquinoline alkaloids. In this study, 4’OMT2 (3′-hydroxy-Nmethylcoclaurine<br />4′-O-methyltransferase) gene was isolated, sequenced and characterized. After<br />amplification of genomic and coding sequence of 4’OMT2 gene using PCR, the fragments were<br />cloned into pTZ57R/T plasmid and sequenced. Sequencing results showed two fragments of<br />1074 and 1189bp for coding and genomic sequences, respectively. For the first time, results<br />showed one intron of 115bp in the genomic sequence of 4’OMT2 in the species. Isolated gene<br />from Iranian genotypes was similar to Papaver genus with high identity, and had 67% identity<br />to Ranunculales plants. Further bioinformatics analyses revealed, 4’OMT2 gene produces a<br />stable enzyme without signal peptide that localize in the cytoplasm. For gene expression<br />analysis, five poppy RNA-seq (mRNA type) libraries (belonging to flower bud, leaf, developing<br />fruit, stem and root tissues) were retrieved from SRA database and analysis of 4’OMT2 gene<br />expression were done using IDEG6 software and statistical tests. Results showed that 4’OMT2<br />has differential expression among different tissues and has maximum expression in stem tissues.<br />Identification and characterization of biosynthetic genes is the first step in genetic manipulation<br />and metabolic engineering. In present study, for the first time, full length coding sequence of<br />4’OMT2 gene was isolated from poppy plant and presence of one intron in its sequence was<br />determined.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.165.52.26.1580.32
<br /> گیاه شقایق (<em>Papaver somniferum</em> L.) یکی از مهمترین گیاهان دارویی جهان بوده و چندین آلکالوئید بنزیل ایزوکوئینولینی دارویی مهم را تولید میکند. در این پژوهش ژن <em>4’OMT2</em> (3′-hydroxy-<em>N</em>-methylcoclaurine 4′-<em>O</em>-methyltransferase) از این گیاه جداسازی، تعیین توالی و تعیین خصوصیت شد. پس از تکثیر توالی کدکننده و ژنومیک ژن <em>4’OMT2</em>با استفاده از PCR<em>، </em>این قطعات در پلاسمید pTZ57R/T همسانهسازی و تعیین توالی شدند. نتایج توالییابی قطعاتی با طول 1074 و 1189 جفت بازی را بهترتیب برای توالی کدکننده و ژنومیک نشان داد. برای اولین بار در این گیاه، نتایج وجود یک اینترون با طول 115 جفت باز را در توالی ژنومیک ژن <em>4’OMT2</em>نشان داد. ژن جداسازی شده از ژنوتیپ ایرانی با همسانی بسیار بالایی به ژن <em>4’OMT2</em>جنس شقایق شباهت داشت و با همسانی بیشتر از 67 درصد به گیاهان راسته آلاله سانان شبیه بود. بررسیهای بیوانفورماتیکی بیشتر نشان داد که ژن <em>4’OMT2</em>آنزیمی پایدار را تولید میکند که بدون سیگنال پپتید بوده و در سیتوپلاسم تجمع پیدا میکند. برای بررسی آنالیز بیان ژن، پنج کتابخانه از دادههای SRA (نوع mRNA) گیاه شقایق مربوط به ترانسکریپتوم جوانه گل، برگ، میوه در حال نمو، ساقه و ریشه از پایگاه SRA دریافت و بیان ژن جداسازی شده <em>4’OMT2</em>در آنها با استفاده از نرمافزار IDEG6 و آزمونهای آماری بررسی شد. نتایج نشان داد که این ژن دارای بیان متفاوتی در بافتهای مختلف گیاه شقایق بوده و بیشترین میزان بیان را در بافت ساقه دارد. شناسایی توالی کدکننده ژنهای بیوسنتزی و بررسی خصوصیات آنها اولین قدم در دستورزی ژنتیکی و بهرهگیری در مهندسی متابولیک است. در این پژوهش برای اولین بار توالی کدکننده کامل ژن <em>4’OMT2</em>از گیاه شقایق جداسازی شد و وجود یک اینترون در ساختار آن مشخص و اثبات شد.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117956_c7b76428124b6e8d0f6988b50a4e6f31.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126213971001Analysis of genetic diversity of Pistacia atlantica Desf. populations from Zagros forests using ISSR, IRAP and SCoT molecular markersمطالعه تنوع ژنتیکی جمعیتهای بنه (Pistacia atlantica Desf.) در جنگلهای زاگرس بر اساس نشانگرهای مولکولی ISSR، IRAP و SCoT17719511795710.22092/ijrfpbgr.2018.117957FAهانیه شاه قبادیدانشآموخته کارشناسی ارشد، جنگلشناسی و اکولوژی جنگل، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه کردستاننقی شعبانیاننویسنده و مسئول مکاتبات، دانشیار، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه کردستان
پست الکترونیک: n.shabanian@uok.ac.comعلی خدیویدانشیار، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراکمحمدشفیع رحمانیدانشجوی دکتری، بیوتکنولوژی گیاهی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران0000-0002-4116-3637Journal Article13971001DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.177.52.26.1605.84 <br /><br />This study was conducted to investigate intra- and inter-population genetic diversity of 15<br />populations of Pistacia atlantica from Zagros forests, represented by 181 genotypes, using 15,<br />12 and 13 primers based on three molecular marker including inter simple sequence repeats<br />(ISSR), inter retrotransposal amplified polymorphism (IRAP) and start codon targeted (SCoT)<br />markers, respectively. ISSR, IRAP and SCoT primers produced a total of 186, 143 and 136<br />bands, of which 162 (87.0%), 130 (90.9%) and 120 (88.0%) showed polymorphisom,<br />respectively. Results showed that all marker systems revealed relatively high genetic variation<br />at population level (hISSR = 0.22, PPLISSR = 61.92%; hIRAP = 0.25, PPLIRAP = 74.19%; hSCoT =<br />0.20, PPLSCoT = 64.09%). According to ISSR, IRAP and SCoT based genetic differentiation<br />coefficient (ΦST; 0.28, 0.23, and 0.22, respectively), a higher level of genetic variation was<br />recorded within populations than that of among populations, that could be due to wind-based<br />extensive gene flow among the populations. UPGMA cluster analysis based on three used<br />molecular systems, devided the studied populations into distinct clusters. According to Mantel<br />test, no significant correlation was recorded between genetic and geographic distances of the<br />populations.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.177.52.26.1605.84<br /> <br /> این مطالعه با هدف ارزیابی تنوع ژنتیکی درون و بینجمعیتی 15 جمعیت بنه (<em>Pistaciaatlantica</em>) شامل 181 ژنوتیپ در جنگلهای زاگرس با استفاده از 15، 12 و 13 آغازگر بهترتیب از نشانگرهای مولکولی توالیهای تکراری ساده میانی (ISSR)، چندشکلی تکثیرشده بین رتروترانسپوزونها (IRAP) و چندشکلی نواحی هدف کدون شروع (SCoT) انجام شد. در نشانگر ISSR، در مجموع 186 نوار تکثیر شد که از این تعداد 162 نوار (87 درصد) چندشکل بودند. این برآوردها در نشانگرهای IRAP و SCoT بهترتیب 143 و 130 (9/90 درصد) و 136 و 120 (88 درصد) بودند. بر اساس نتایج بهدست آمده، هر سه نشانگر تنوع ژنتیکی بالایی را در سطح جمعیت نشان دادند (ISSR: 22/0 =<em>h</em>، درصد لوکوسهای چندشکل= 92/61 درصد؛ IRAP: 25/0 =<em>h</em>، درصد لوکوسهای چندشکل= 19/74 درصد؛ SCoT: 20/0 =<em>h</em>، درصد لوکوسهای چندشکل= 09/64 درصد). مقدار عددی ضریب تمایز ژنتیکی بینجمعیتی (Φ<sub>St</sub>) از نشانگرهای مورد استفاده یعنی ISSR، IRAP و SCoT بهترتیب برابر با 28/0، 23/0 و 22/0 محاسبه شد که نمایانگر بیشتر بودن سهم تنوع ژنتیکی درونجمعیتها از تنوع ژنتیکی بین جمعیتهاست؛ و تجزیه واریانس مولکولی نیز آن را تأیید کرد. ضعیفبودن تمایز ژنتیکی بین جمعیتها در مقابل پایههای داخل جمعیتها میتواند ناشی از جریان ژنی گسترده مبتنی بر گردهافشانی بهکمک باد بین ژنوتیپهای بنه در گستره جغرافیایی این مطالعه باشد. تجزیه خوشهای UPGMA مبتنی بر سه نشانگر مولکولی مورد استفاده، 15 جمعیت <em>P. atlantica</em>انتخابشده برای این مطالعه را در خوشههای مجزا تفکیک کرد. آزمون مانتل همبستگی بین فاصله ژنتیکی جمعیتها و فاصله جغرافیایی آنها را معنیدار نشان نداد.<br /> <strong><em> </em></strong>https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117957_d68dbcb72dc9e66ff76fe47035996f48.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Genetic diversity of several Iranian sumac (Rhus coriaria) populations using genomic inter-microsatellites markersبررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای مختلف سماق (Rhus coriaria L.) ایرانی با استفاده از نشانگر ISSR19620611795910.22092/ijrfpbgr.2018.117959FAرسول محمدی آلاگوزدانشآموخته کارشناسی ارشد، بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیهرضا درویش زادهنویسنده مسئول مکاتبات، استاد، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه
پست الکترونیک: r.darvishzadeh@urmia.ac.irاحمد علیجانپوردانشیار، گروه جنگلداری، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه ارومیهحمید حاتمی ملکیاستادیار، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغهرویا حیدریدانشآموخته کارشناسی ارشد، بیوتکنولوژی کشاورزی، پژوهشکده زیستفناوری، دانشگاه ارومیهJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.196.52.26.1576.82
<br />Sumac (Rhus coriaria L.) as a forest shrub has been dispersed in Mediterranean and Eastern<br />Asia specially Iran and has several medicinal and industrial applications. In this research, intermicrosatellites<br />markers were used to study genetic diversity of sumac genotypes collected from<br />five natural habitats located in North West of Iran (West and East Azerbaijan provinces).<br />Fifteen samples were select randomly from each population and genomic DNA was<br />fingerprinted by 18 ISSR markers. Results revealed existence of suitable genetic variation<br />among the studied sumac genotypes and portion of inter population (79.8%) variation were<br />higher than intra population (20.2%) variation. Minimum value of genetic distance (14.18) was<br />observed between Aghberaz-Horand (East Azerbaijan province) and Nir-Arasbaran (East<br />Azerbaijan province) populations and the maximum one (31.08) was observed between<br />Kachelleh-Urmia (West Azerbaijan) and Nir-Arasbaran populations. According to classification<br />of genotypes based on molecular data, Aghberaz-Horand and Nir-Arasbaran populations located<br />in the same group and populations from other habits located in distinguished groups.<br />Classification of genotypes via ISSR markers was in agreement with their geographical<br />distributions. ISSR markers could be effectively applicable in genetic evaluation of sumac<br />germplasm and also in identification of genetic relatedness among known and unknown sumac<br />samples.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.196.52.26.1576.82
<br /> سماق (<em>Rhus coriaria</em> L.) ازجمله درختچههای جنگلی است که در مناطق مدیترانه و آسیای شرقی بهویژه ایران پراکنش دارد و دارای کاربردهای مختلف دارویی و صنعتی میباشد. در این پژوهش، از نشانگرهای بین ریزماهواره بهمنظور مطالعه تنوع ژنتیکی ژنوتیپهای سماق جمعآوری شده از پنج رویشگاه طبیعی واقع در شمالغرب کشور (استانهای آذربایجانغربی و شرقی) استفاده شد. بدینمنظور از هر جمعیت 15 نمونه بهصورت تصادفی انتخاب و بعدDNA ژنومی آنها با استفاده از 18 آغازگر ISSR انگشتنگاری شد. نتایج نشان داد که تنوع ژنتیکی مطلوبی در میان ژنوتیپهای مورد مطالعه سماق وجود دارد، بهطوریکه سهم تنوع ژنتیکی بین جمعیتی (8/79%) بیشتر از سهم تنوع ژنتیکی داخل جمعیتی (2/20) بود. کمترین فاصله ژنتیکی (18/14) بین جمعیتهای آغبراز- هوراند (آ.ش.) و نیر- ارسباران و بیشترین فاصله ژنتیکی (08/31) بین جمعیتهای کچله- ارومیه و نیر- ارسبارن مشاهده شد. بر اساس نتایج حاصل از گروهبندی ژنوتیپهای مورد مطالعه، دو جمعیت آغبراز- هوراند و نیر- ارسباران در یک گروه و جمعیتهای رویشگاههای دیگر در گروههای مجزایی قرار گرفتند. نتایج این مطالعه نشان داد که گروهبندی افراد با استفاده از نشانگر ISSR، با توزیع جغرافیایی آنها مطابقت دارد. نشانگرهای ISSR میتوانند بهصورت مؤثری نه تنها در ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرمپلاسم سماق بلکه در شناسایی ارتباط ژنتیکی میان نمونهها یا افراد شناخته شده و یا ناشناخته سماق بهکار روند.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117959_7a1b7fee4022449ac9015b9410eceeac.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Application of SCoT marker to discriminate Lolium perenne and Lolium multiflorum speciesکارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تمایز دو گونه Lolium perenne و Lolium multiflorum20722011796010.22092/ijrfpbgr.2018.117960FAمحسن فرشادفرمسئول مکاتبات، دانشیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، پست الکترونیکی: farshadfarmohsen@yahoo.comهومن شیروانیمدرس گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور0000-0001-8028-4311مصطفی امجدیانمربی، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نورآنیتا یاقوتی پوردکترای اصلاح نباتات، گروه زراعت و اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه رازی، کرمانشاهJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.207.52.26.1603.109
<br />Lolium is an important cool season grass species growing in different climates. To identify<br />variation among nine Lolium multiflorum and nine Lolium perenne genotypes, this experiment<br />was carried out based on 15 SCoT molecular markers. All of the SCoT primers showed 86<br />visible bands. Seventy four out of 86 bands were polymorphs. Primers SC35, SC36 and SC26<br />(with 9 and 8 bands respectively) showed the highest number of bands and SC10 and SC44<br />(with 2 and 3 bands) showed the lowest number of bands. The greatest number of band for<br />polymorphic information content (PIC) belonged to SC5، SC40، SC35 ،SC63 ،SC13, C44،<br />SC26 ،SC21and SC10. The greatest Resolving Power (RP), Marker Index (MI), Effective<br />Multiplex Ratio (EMR) belonged to SC35 andSC26 primers. Genetic similarity based on<br />Jaccard coefficient ranged from 0.35 to 0.91. Mean similarity between the genotypes was 0.64.<br />Cluster analysis grouped genotypes into two groups. The results of clustering was confirmed by<br />principal coordinate (PCo) analysis. Analysis of molecular variance of annual and perennial<br />species revealed that variation within species was 51% and variation between species was 49%.<br />Based on heterogeneity (He) and Shannon indices (I), the highest intraspecific variability and<br />gene variation belonged to L. Multiflorum.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.207.52.26.1603.109
<br /> چچم یکی از گیاهان مهم علوفهای در مناطق سردسیری جهان میباشد و در شرایط مختلف آب و هوایی رشد میکند. تنوع ژنتیکی دو گونه بین نه ژنوتیپ از <em>Lolium perenne</em> و نه ژنوتیپ از <em>Lolium multiflorum</em> با استفاده از 15 نشانگر مولکولی SCoT بررسی شد. آغازگرهای ScoT در مجموع 86 باند تولید کردند که از این تعداد 12 باند یکشکل مشاهده شد و سایر باندها چندشکل بودند. آغازگرهای SC35، SC36 و SC26 بهترتیب با 9 و 8 باند بیشترین تعداد باند و آغازگرهای SC10 و SC44 با 2 و 3 باند کمترین تعداد باند را نشان دادند. بیشترین میزان محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) مربوط به آغازگرهای SC5، SC40، SC35، SC63، SC13، SC44، SC26، SC21 و SC10 بود. بهطوریکه بیشترین میزان شاخص قدرت تفکیک (RP)، شاخص نشانگری (MI) و نسبت چندگانه مؤثر (EMR) را آغازگرهای SC35 و SC26 داشتند. تشابه ژنتیکی ژنوتیپهای مورد بررسی با استفاده از ضریب تشابه جاکارد از 35/0 تا 91/0 متغیر بود و میانگین تشابه بین ژنوتیپها برابر 64/0 بود. بر اساس تجزیه خوشهای ژنوتیپها در 2 گروه قرار گرفتند، بهطوریکه گونهها بهصورت صد در صد از یکدیگر تفکیک شدند. این نتایج با نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) تأیید شد. تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) بر اساس گونههای یکساله و چند ساله نشان داد که تنوع در درون گونهها برابر 51% و در بین گونهها برابر 49% بود. بر اساس شاخصهای هتروژنتیکی مورد انتظار (He) و شاخص شانون (I) بیشترین تنوع درون گونهای و تنوع ژنی مربوط به گونه<br /> <em>L. Multiflorum</em> بود.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117960_4b0c88d6fbb8b2011ec8dec96abe1b86.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Investigating morphological characteristics and genetic relationships between two populations of Ferula pseudalliacea in Yazd Provinceبررسی خصوصیات مورفولوژیکی و روابط ژنتیکی بین دو جمعیت از گونه Ferula pseudalliacea در استان یزد22123211796110.22092/ijrfpbgr.2018.117961FAسمیرا حسین جعفرینویسنده مسئول، دانشجوی دکتری، علوم مرتع، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان
پست الکترونیک: Samirahosseinjafari@yahoo.comعادل سپهریاستاد، گروه مدیریت مرتع، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگانحسن سلطانلودانشیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگانعلی اکبر کریمیاندانشیار، گروه مرتع و آبخیزداری، دانشکده منابع طبیعی و کویرشناسی، دانشگاه یزد، یزدJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.221.52.26.1576.32
Ferula pseudalliacea (bitter assafoetida) is a rangeland plant which its gum has a lot of<br />medicinal properties. Since there is no report about evaluating genetic diversity of the valuable<br />species in Iran, this is the first study to investigate genetic diversity of the species in its habitats<br />in Yazd province using several morphological traits and ISSR markers. Among 9 traits, there<br />was significant differences between habitats in terms of canopy cover, stem diameter and weight<br />of 1000 seed. Cluster analysis by morphological traits on the basis of Ward's method classified<br />the samples into three main groups. Among 22 primers, 8 primers reproduced the pattern DNA<br />well and revealed 224 sharp bands. ISSR-16 and ISSR-55 primers had better performance<br />according to the number of bands, PIC and Marker Index. Cluster analysis using Jacquard's<br />coefficient and UPGMA method, grouped two populations into 10 clusters. Principal<br />coordinates analysis showed three components explained 57.94 percent of total variance and<br />separated the populations from each other. These grouping matched relatively with the<br />geographical regions. AMOVA showed that within group genetic diversity (92%) was more<br />than between group diversity (8%). Comparing morphological and molecular dendrograms<br />revealed that there was no similarity between them. The results showed that ISSR marker was<br />suitable to investigate genetic diversity among the studied populations of the species.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.221.52.26.1576.32
گونه<em>Ferula </em><em>pseudalliacea</em> (آنغوزه تلخ) گیاهی مرتعی است که شیرابه آن دارای خواص دارویی فراوان میباشد. این پژوهش اولین مطالعه در ایران بهمنظور بررسی روابط ژنتیکی این گونه در رویشگاههایش در استان یزد با استفاده از برخی صفات مورفولوژیک و نشانگرهای مولکولی ISSR انجام شد. از میان 9 صفت تنها صفات تاجپوشش، قطر یقه و وزن هزاردانه دارای اختلاف معنیداری بین دو رویشگاه بود. تجزیه خوشهای صفات مورفولوژیک براساس روش Ward گیاهان را در 3 گروه اصلی قرار داد. از میان 22 آغازگر مورد مطالعه، 8 آغازگر DNA الگو را بهخوبی تکثیر و در مجموع 224 نوار قابل امتیازدهی ایجاد کردند. براساس تعداد باند، PIC و شاخص نشانگر، پرایمرهای ISSR-16 و ISSR-55 عملکرد بهتری داشتند. تجزیه خوشهای با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و الگوریتم UPGMA، دو جمعیت مورد مطالعه را در 10 خوشه گروهبندی کرد. در تجزیه به مختصات اصلی 94/57% از واریانس کل توسط سه مؤلفه بیان شد و جمعیتها را بهطور کامل از یکدیگر جدا کرد. نتایج این آنالیز با تجزیه خوشهای همخوانی داشت. این گروهبندیها با محدوده پراکندگی جغرافیایی نمونهها تاحدی انطباق داشت. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که تنوع ژنتیکی درون جمعیتها (92%) بیشتر از تنوع بین جمعیتها (8%) بود. تطابق دندروگرامهای مورفولوژیکی و مولکولی نشان داد که تشابه چندانی بین این دو گروهبندی وجود ندارد. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که استفاده از نشانگر ISSR برای ارزیابی تنوع ژنتیکی بین جمعیتهای این گونه مناسب بود.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117961_b13a077c4fe01b3e422dd0ee57764768.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Tissue culture and organogenesis of Iranian mountain ash (Sorbus persica Hedl.)مطالعه کشت بافت و اندامزایی بارانک ایرانی (Sorbus persica Hedl.)23324311796210.22092/ijrfpbgr.2018.117962FAمسعود اسماعیلی شریفنویسنده مسئول، استادیار، بخش تحقیقات منابع طبیعی، مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان اصفهان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، اصفهان
پست الکترونیک: m.esmaeilisharif@areeo.ac.ir0000-0001-7137-0234سید محمد حسینی نصردانشیار، گروه جنگلداری، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری0000-0002-1812-9094عباس قمری زارعدانشیار، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهرانمجید طالبی بدافدانشیار، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهانJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.233.52.26.1605.32
<br />Iranian mountain ash (Sorbus persica Hedl.) is one of the endangered species with great<br />values in terms of soil conservation, climate stratification, medicinal properties, high resistance<br />to frost, and importance of habitat for wildlife. Present research was conducted with the aim of<br />achieving to an appropriate method of micropropagation of the species. Nodal segments were<br />taken from stem axis of in vitro elongated plants. The segments were cultured on WPM<br />medium, supplemented with 27 hormonal composition of BAP, IBA and TDZ. Then the<br />resulting shoots were transferred to a media supplemented with various concentrations of IBA<br />or NAA for rooting induction, and finally they were moved to a greenhouse. Percentages of<br />regeneration of the explants were 98 -100%. The highest number of shoots was obtained by<br />TDZ (0.23 μM) + IBA (0.1 μM) and BA (4.4 μM), the highest shoot length (5.2 cm) was<br />obtained by TDZ (0.0 μM) + IBA (0.0 μM) and BA (4.4 μM) and the highest number of nodes<br />(8) was achieved by TDZ (0.23 μM) + IBA (0.0 and 0.1 μM) and BA (2.2 and 4.4 μM). There<br />was a significant difference between IBA concentrations in different treatments for rooting<br />percentage. Maximum rooting percentage was 14.7% in IBA concentration of 5 μm. The rooted<br />segments were successfully acclimated to greenhouse conditions. Results of the experiment<br />showed that in the absence of BAP hormone, umber of shoots produced by the segments<br />significantly were decreased for all of the tested treatments. Fifteen percent of the transferred<br />explants to the rooting media produced one to three roots per explant.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.233.52.26.1605.32
<br /> بارانک ایرانی (Sorbus persica Hedl.) در فهرست گیاهان در آستانه انقراض بوده و از نظر حفاظت خاک، تلطیف آب و هوا، خواص دارویی، اهمیت رویشگاهی، مأمن حیات وحش و مقاومت بالا در برابر سرما از ارزش زیادی برخوردار است. این پژوهش با هدف دستیابی به روش مناسب ریزازدیادی گونه بارانک ایرانی اجرا شد. قطعههای گرهای از نهالهای بذری بارانک ایرانی تهیه شده و در ظروف شیشهای حاوی محیط کشت WPM با 27 ترکیب هورمونی BAP، TDZ و IBA کاشته شدند. سپس شاخسارههای حاصل، برای القاء ریشهزایی در محیط کشت حاوی سطوح مختلف IBA یا NAA واکشت و در نهایت به محیط خارج از شیشه منتقل شدند. درصد باززایی کلیه تیمارها 100-98 درصد بود. بیشترین تعداد شاخساره (13 عدد) در تیمار (μM4/4) BAP + (μM1/0) IBA + (μM23/0) TDZ، بیشترین طول شاخساره (cm 5/2) در اثر متقابل هورمونهای (μM4/4) BAP + (μM0/0) IBA + (μM0/0) TDZ و بیشترین تعداد گره (8 عدد) در تیمار هورمونی (μM2/2 و μM4/4)BAP +(μM0/0 و μM1/0) IBA+(μM23/0) TDZ حاصل شد. اختلاف معنیداری بین غلظت IBA در تیمارهای مختلف از نظر درصد ریشهزایی ملاحظه شد و حداکثر ریشهزایی (7/14%) در تیمار 5 میکرومولار حاصل شد. نهالهای ریشهدار شده در شرایط درون شیشهای، با موفقیت در شرایط گلخانه مستقر شدند. در غیاب هورمون BAP تعداد شاخسارههای تولید شده بهطور معنیداری کاهش یافت. پانزده درصد از گیاهانی که بهمحیط ریشهزایی منتقل شدند، یک تا سه ریشه در هر ریزنمونه تولید کردند.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117962_4cc7d1e9214fa2196cd1143db7d69817.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Assessment of NAC2, MYB and CBF14 genes expression in susceptible and resistant Aegilops genotypes to salinityارزیابی الگوی بیان ژنهای NAC2، MYB و CBF14 ژنوتیپهای حساس و مقاوم به شوری در آژیلوپس(Aegilops)24425311796310.22092/ijrfpbgr.2018.117963FAعلی محمودیدانش آموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت0000-0002-1864-4766علی اعلمینویسنده مسئول مکاتبات، دانشیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت
پست الکترونیک:ali_aalami@guilan.ac.irحسن حسنی کوملهاستادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشتمسعود اصفهانیاستاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشترضا شیرزادیاناستادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشتJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.244.52.26.1575.41
<br />Salinity is one of the main environmental factors limiting production and distribution of<br />plants worldwide. Aegilops is a wild species from grasses family with useful genes such as<br />environmental stress tolerance. Two genotypes, 575 from Aegilop cylindrica as resistant and<br />675 from Aegilop crassa as sensitive to salinity were used base on previous experiments in<br />salinity stress. After seed germination, the seedlings were transferred to a sandy environment<br />under controlled light and temperature conditions and irrigation was performed under two<br />normal conditions and 200 mM salinity with Hoagland solution. Leaf tissue samples were taken<br />at 0, 6, 24, 48 and 72 hours after salinity treatments. After extracting the RNA and the cDNA<br />synthesis, its accuracy was verified by 18S rRNA. The expression of the three transcription<br />factors of CBF14, NAC2 and MYB was investigated by using Real Time-PCR. Results showed<br />that NAC2 and CBF14 transcription factors had the highest expression at 48 hours after salinity<br />stress, but the MYB gene had the highest expression at 24 hours after stress. Overall, the<br />expression of CBF14, NAC2, and MYB genes in the 575 genotype compared with genotype 675<br />was in higher level in all hours. The results showed that the three mentioned genes play<br />important role in salt tolerance in the tolerant genotype, therefore, considering the high genetic<br />similarity between Aegilops and wheat, the genes can be as candidate genes for using in wheat<br />breeding programs.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.244.52.26.1575.41
<br /> تنش شوری یکی از اصلیترین عوامل محیطی است که تولید و توزیع جغرافیایی گیاهان را در سراسر جهان محدود میکند. آژیلوپس یک جنس وحشی از خانواده گندمیان است که دارای ژنهای مفید همانند تحمل به تنشهای محیطی میباشد. در این آزمایش ژنوتیپ 575 از گونه <em>Aegilops cylindrica</em> بهعنوان مقاوم و ژنوتیپ 675 از گونه <em>Aegilops crassa</em> بهعنوان حساس که بر پایه آزمایشهای پیشین در تنش شوری شناسایی شده بودند، استفاده شد. پس از جوانهزنی بذرها، گیاهچهها در شرایط کنترل شده نوری و دمایی بهمحیط ماسه منتقل و آبیاری در دو شرایط نرمال و تنش شوری 200 میلی مولار با محلول هوگلند انجام گردید. نمونهبرداری از بافت برگ در زمانهای صفر، شش، 24، 48 و 72 ساعت پس از تیمار شوری انجام شد. پس از استخراج RNA و ساخت cDNA صحت آن با 18S rRNA تأیید و بیان ژنهای سه عوامل رونویسی <em>CBF14</em>، <em>NAC2</em> و <em>MYB</em> از طریق Real Time-PCR بررسی شد. نتایج نشان داد که فاکتورهای رونویسی <em>NAC2</em><em> </em>و <em>CBF14</em> 48 ساعت پس از اعمال تنش شوری بالاترین میزان بیان را داشتند، ولی ژن <em>MYB</em> بیشترین بیان را 24 ساعت پس از اعمال تنش داشت. در مجموع بیان ژنهای <em>CBF14</em><em>، </em><em>NAC2</em><em> و </em><em>MYB</em>در ژنوتیپ متحمل 575 در مقایسه با ژنوتیپ 675 در تمامی ساعات بیان نسبی بیشتری داشت. این نتایج نشان میدهد که سه ژن فوق نقش کلیدی و مهمی در اعطای تحمل به تنش شوری در ژنوتیپ متحمل دارند، بنابراین با توجه بهقرابت ژنتیکی بالای آژیلوپس و گندم میتوانند پس از آزمایشهای تکمیلی بهعنوان ژنهای کاندیدا برای استفاده در برنامههای بهنژادی گندم بهکار روند.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117963_be66269a3d340d5c5d853398c966c136.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Evaluation of genetic diversity effects on morpho-physiological and antioxidant responses in different species of Aegilops under drought stressمطالعه اثر تنوع ژنتیکی در پاسخ مورفو- فیزیولوژیکی و آنتیاکسیدانی گونههای مختلف آژیلوپس به تنش خشکی25426711796410.22092/ijrfpbgr.2018.117964FAصدیقه فابریکی اورنگاستادیار، هیات علمی دانشگاه بینالمللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران0000-0001-5995-3752بتول شهیدیدانشجوی کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بینالمللی امام خمینی (ره)، قزوینJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.254.52.26.1605.1610
<br />This experiment was conducted to investigate the effect of drought stress on photosynthetic<br />pigments contents, biomass of roots and shoots, total protein content and antioxidant enzymes<br />activity and non-enzymatic antioxidant of six species of Aegilops genus along with two drought<br />resistant and susceptible wheat cultivars as checks in a factorial based on randomized complete<br />block design with three replications. Drought stress treatments were applied at three levels of<br />non-stress (FC=100%), moderate stress (FC=50%) and severe stress (FC=25%) conditions. Ae.<br />caudata, Ae. triuncialis and Ae. cylindrica were ranked higher than resistance cultivar, Sirvan,<br />as check in term of root fresh and dry weights under stresses. The highest total chlorophyll<br />content was related to Ae. cylindrica, Ae. umbellulata and Ae. caudata in stresses. Carotenoid<br />showed decreasing trend in all studied species except for Ae. umbellulata, and Ae cylindrica had<br />the highest amount at both stress and non- stress conditions. The highest SOD under severe<br />stress was observed in Ae. crassa and Sirvan as resistant cultivar. Maximum APX under severe<br />stress was observed in Ae. triuncialis and Ae. caudata and the lowest activity was in Ae.<br />neglecta. The highest level of GPX was observed in Ae. triuncialis, Ae. caudata and Sirvan<br />cultivar under drought stress. Also the maximum CAT enzyme under severe stress was<br />observed in Ae. triuncialis, Ae. caudata and Ae. crassa, respectively, and Ae. umbellulata and<br />Darya cultivar had the lowest amount of CAT enzyme. In conclusion, because the three species<br />Ae. caudata, Ae. triuncialis and Ae. cylindrica had the highest amounts for the traits associated<br />with increased drought tolerance, including root volume, carotenoid, CAT, GPX and APX<br />enzymes, and also these species were same in having CC genome. Therefore, it seems that the<br />CC genome could have a high potential for future wheat breeding programs in increasing of<br />drought tolerance.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.254.52.26.1605.1610
<br /> این آزمایش بهمنظور بررسی اثر تنش خشکی بر محتوای رنگیزههای فتوسنتزی، وزن ریشه و اندامهوایی، محتوای پروتئین کل و فعالیت آنزیمهای آنتیاکسیدان آنزیمی و غیرآنزیمی در شش گونه مختلف از جنس <em>Aegilops</em> بههمراه دو رقم گندم نان مقاوم و حساس به تنش خشکی بهعنوان شاهد، در قالب فاکتوریل بر پایه طرح بلوکهای کامل تصادفی با سه تکرار اجرا شد. تیمارهای تنش خشکی در سه سطح عدم تنش (FC=100%)، تنش متوسط (FC=50%) و تنش شدید (FC=25%) اعمال شد. گونههای<br /> <em>Ae. caudata</em><em>، </em><em> Ae. triuncialis</em> و<em>Ae. cylindrica</em>از نظر صفات وزن تر و خشک ریشه در شرایط تنش نسبت به رقم شاهد مقاوم سیروان در رتبه بالاتری قرار گرفتند. بیشترین مقدار کلروفیل کل در شرایط تنش متوسط در <em>Ae. cylindrica</em> و <em>Ae. umbellulata</em> و در تنش شدید در گونه <em>Ae. caudata</em> مشاهده شد. در تمام گونههای مورد مطالعه بهجز گونه <em>Ae. umbellulata</em> در اثر تنش خشکی میزان کاروتنوئید روند کاهشی نشان داد و گونه <em>Ae. cylindrica</em> نسبت به سایر گونهها از بیشترین مقدار برخوردار بود. بالاترین مقدار آنزیم سوپراکسید دیسموتاز در خشکی شدید در گونه <em>Ae. crassa</em> و رقم مقاوم <em> </em>Sirvanو کمترین مقدار آن در گونه <em>Ae. neglecta</em> مشاهده گردید. بیشترین آنزیم آسکوربات پراکسیداز در خشکی شدید در گونههای <em>Ae. triuncialis</em> و <em>Ae. caudata</em> و کمترین مقدار آن در گونه <em>Ae. neglecta</em> مشاهده شد. بالاترین مقدار آنزیم گایاکول پراکسیداز در گونههای <em>Ae. triuncialis</em>، <em>Ae. caudata</em> و رقم مقاوم Sirvan در تنش خشکی مشاهده شد و گونههای <em>Ae. triuncialis</em>، <em>Ae. caudata</em> و <em>Ae. crassa</em> بیشترین و گونه<br /> <em>Ae</em>.<em> umbellulata</em> و رقم حساس Darya کمترین مقدار آنزیم کاتالاز را در خشکی شدید داشتند. در جمعبندی کلی، نظر به اینکه سه گونه <em>Ae. caudat</em>a، <em>Ae. Triuncialis</em> و <em>Ae. Cylindrica</em> از نظر اغلب صفات مرتبط با تحمل خشکی ازجمله حجم ریشه، کارتنوئید و آنزیمهای CAT، GPX و APX بالاترین مقدار را داشتند و هر سه گونه در ژنوم CC مشترک بودند، ازاینرو بهنظر میرسد ژنوم CC بتواند ظرفیت بالایی در برنامههای اصلاحی آینده گندم برای افزایش مقاومت به خشکی داشته باشد. <br /> https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117964_f25a0da0831ccadabff5bb6c3382c36c.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Genetic variability of Tanacetum polycephalum populations in West Azarbaijan using ISSR molecular markersبررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای گونه (Tanacetum polycephalum) آذربایجانغربی با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR26827811796510.22092/ijrfpbgr.2018.117965FAمهران مجردنویسنده مسئول، دانشجوی دکتری، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، پردیس دانشگاهی دانشگاه ارومیه، ارومیه
پست الکترونیک: gmail.com@Mojarrad2017سیاوش حسینی سرقیناستادیار، گروه زیستشناسی، دانشکده علوم، دانشگاه ارومیه، ارومیهعلی سنبلیدانشیار، پژوهشکده گیاهان و مواد اولیه دارویی، دانشگاه شهید بهشتی، تهرانرضا حیدریاستاد، گروه زیستشناسی، دانشگاه غیرانتفاعی صبا، ارومیهJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.268.52.26.1576.82
<br />Tanacetum polycephalum from Anthemideae tribe of Asteraceae family is a rangeland<br />species with high morphological diversity and vast dispersal in Northwest, East and centre parts<br />of Iran. The purpose of this research was studying genetic diversity of 20 populations of T.<br />polycephalum in West Azarbayjan using ISSR molecular marker. Ten ISSR primers out of 14<br />primers could be scored based on presence or absence of each band. Over all 208 bands were<br />produced .The range number of bands was between 15(IS24) to 28 (IS20) and the average was<br />20.8. Regarding the polymorphism bands percentage, IS8, IS1, IS10, IS13, IS20 markers had<br />high percentage (100) and IS24 marker had the lower percentage (80) and mean percentage of<br />polymorphism of the primers was %96.03. PIC, RP, EMR and MI means were 0.30, 6.06, 19.5<br />and 6.13 respectively. Over all the most effective markers were IS8, IS1 and IS10. Results of<br />cluster analysis revealed the grouping of studied populations in 2 main and 4 subgroups, in<br />which the different populations collected from the same locality were located in the same group.<br />Therefore, a close relationship was characterized between geographic location and genetic<br />diversity and it may be concluded that geographic and climatic factors could be one of the<br />responsible main factor for genetic diversity.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.268.52.26.1576.82
<br /> گونه <em>Tanacetum polycephalum</em> متعلق به قبیله بابونه از تیره کاسنی (Asteraceae-Anthemideae) و یکی از گونههای مرتعی با پراکنش وسیع در شمالغرب، شرق و مرکز ایران است که از تنوع مورفولوژیکی بالایی برخوردار است. هدف از این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی 20 جمعیت از گونه مذکور در آذربایجانغربی با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR بود. از 14 نشانگر ISSR مورد استفاده 10 نشانگر چند شکلی بالاتری داشتند و بر اساس وجود یا عدم وجود باند امتیازدهی شدند. در مجموع 208 باند تکثیر شد که تعداد آنها از 15 (برای نشانگر 24IS) تا 28 (برای نشانگر 20IS) متغیر و میانگین باندهای تولید شده 8/20 بود. از نظر درصد باندهای چندشکل (%P) نشانگرهای IS8، IS1 ،IS10، IS13 و IS20 بیشترین درصد (100) و نشانگر IS24 کمترین درصد (80) را نشان داد و میانگین درصد چندشکلی برای کل نشانگرها 03/96 درصد بود. میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC)، قدرت تفکیک (RP)، نسبت سهم مؤثر (EMR) و شاخص نشانگر (MI) بهترتیب برابر با 30/0، 06/6، 5/19 و 13/6 بهدست آمد. در مجموع نشانگرهای IS8، IS1 و IS10 مؤثرترین نشانگر در بررسی تنوع جمعیتهای گونه مورد مطالعه بودند.گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای نشان داد که جمعیتها در دو گروه و چهار زیرگروه قرار گرفتند و جمعیتهای جمعآوری شده از یک منطقه در گروهها و زیرگروههای مشابه قرار گرفتند؛ ازاینرو ارتباط نزدیکی بین مناطق جغرافیایی و تنوع زنتیکی وجود داشت. به این ترتیب شرایط جغرافیایی و اقلیمی میتواند یکی از عوامل تنوع بالای جمعیتها باشد.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117965_10652a3129b1962d4ded257818710c52.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Ecotypic diversity alteration of Quercus castaneifolia populations in different elevation classes of forest (case study: East of Golestan province)تغییرات تنوع اکوتیپی جمعیتهای گونه بلندمازو (Quercus castaneifolia) در طبقات ارتفاعی مختلف جنگل (مطالعه موردی: جنگلهای شرق استان گلستان)27929111796610.22092/ijrfpbgr.2018.117966FAاعظم احمدی مزرعچهدانشآموخته کارشناسی ارشد جنگلشناسی و اکولوژی جنگل، دانشکده علوم جنگل، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگانداوود آزادفرنویسنده و مسئول مکاتبات، دانشیار، بیوتکنولوژی جنگل، دانشکده علوم جنگل، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان،
پست الکترونیکی: azadfar.d@gmail.comزهره سعیدیدانشآموخته دکترای علوم جنگل، دانشکده علوم جنگل، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگانJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.279.52.26.1578.41
<br />Knowledge and understanding the genetic diversity of species is very important for<br />adaptation to environmental changes and their long-term survival and also for the management<br />of forest genetic resources conservation. Therefore, study of industrial or ecologically important<br />species should be done in order of priority. The aim of this research was exploring the ecotypic<br />diversity changes of Quercus castaneifolia populations in elevation classes of Golestan province<br />(low, middle, and upper elevation) by the qualitative study of peroxidase biochemical marker in<br />the biennial branches of six different populations. Qualitative study of peroxidase marker was<br />done by vertical electrophoresis and PAGE method (Poly Acrylamide Gel Electrophoresis).<br />Based on the results, populations of altitudinal classes were different regarding amount of<br />diversity and ecotypes were separable from each other. Therefore, index bases in the seed<br />production areas should be determined and their natural regeneration should be increased and<br />gene flow should be improved through the seeds of index bases of the adjacent populations with<br />similar ecological conditions with controlling the number of selected index bases considering<br />the increased diversity in each habitat.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.279.52.26.1578.41
<br /> آگاهی و شناخت تنوع ژنتیکی گونهها برای سازگاری با تغییرات محیطی و بقای طولانی مدت آنها و همچنین مدیریت حفاظت منابع ژنتیکی جنگل بسیار مهم و حیاتی است و باید برای گونههای مهم صنعتی یا اکولوژیکی در اولویت مطالعه قرار گیرد. هدف از این پژوهش بررسی تغییرات تنوع اکوتیپی جمعیتهای بلندمازو در طبقههای ارتفاعی (ارتفاع پایینی، میانی و بالایی) شرق استان گلستان، با استفاده از فعالیت کیفی نشانگر بیوشیمیایی پراکسیداز شاخههای دوساله در شش جمعیت مختلف بود. مطالعه کیفی نشانگر پراکسیداز با استفاده از الکتروفورز عمودی و بهروش الکتروفورز ژل پلی اکریل آمید (PAGE) انجام شد. نتایج نشان داد که جمعیتهای طبقههای ارتفاعی از نظر میزان تنوع در هر دو رویشگاه متفاوت بوده و جمعیت بالایی رویشگاه علیآباد کتول دارای بیشترین تنوع بودند. بنابراین برای افزایش تنوع باید ضمن تعیین پایههای شاخص اکوتیپی در محوطههای بذرگیری هر منطقه و کمک به تجدید حیات طبیعی آنها، نسبت به جریان ژنی از طریق بذر پایههای شاخص جمعیتهای همجوار با شرایط اکولوژیک مشابه همراه با کنترل تعداد پایههای شاخص انتخابی با توجه به نیاز افزایش تنوع در هر رویشگاه اقدام نمود.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117966_cf257ef97459e23e376d257412ba35a4.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222The study of genetic diversity of cumin ecotypes of Khorasan provinces using protein markersبررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپهای زیرهسبز خراسان با استفاده از نشانگرهای پروتئینی29230111796710.22092/ijrfpbgr.2018.117967FAمحمد ضابطگروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند0000-0003-2605-996xآتنا رحیمیدانشجوی سابق کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجندعلی ایزانلواستادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجندزهره علیزادهاستادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجندJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.292.52.26.1576.1610
<br />Cuminum cyminum is one of the oldest and most economically important species in the<br />Apiaceae family that has the highest cultivated areas of Khorasan provinces in Iran. Genetic<br />diversity of 20 ecotypes of Cuminum cyminum was investigated by protein markers. The<br />ecotypes were randomly collected from three provinces of North, Razavi and South Khorasan<br />provinces. Protein profile analysis was carried out by SDS-PAGE method. The method<br />included: extracting protein from the sample seeds, determining samples concentration, and<br />finally running on electrophoresis gel. Analysis of molecular variance showed that there was<br />variation between and within the populations. Based on the protein markers %24 of the<br />variations belonged to between populations and %76 belonged to within populations.<br />Polymorphism percentage, polymorphic content mean, Shannon's information index and the<br />average of Nei's information index were 27%, 0.01, 0.49, and 0.68, respectively. Results of<br />PCoA showed that the first three components accounted for 83% of the variation. Cluster<br />analysis based on the similarity matrix classified the studied ecotypes in 5 clusters.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.292.52.26.1576.1610
<br /> زیره سبز یکی از قدﻳﻤﻲﺗﺮﻳﻦ و از ﻧﻈﺮ اﻗﺘﺼﺎدی مهمترین ﮔﻮﻧﻪ در ﺧﺎﻧﻮاده چتریان است که بالاترین سطح زیر کشت در استانهای خراسان را دارد. در این تحقیق تنوع ژنتیکی 20 اکوتیپ زیرهسبز با پراکندگی کامل از سه استان خراسان شمالی، رضوی و جنوبی توسط نشانگرهای پروتئینی بررسی گردید. بررسی تغییرات پروتئین با روش SDS-PAGE با طی مراحل استخراج پروتیئن از بذر، تعیین غلظت نمونهها و بعد انجام الکتروفورز انجام شد. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که بین و درون جمعیتها تنوع وجود داشت. بر اساس نشانگر پروتئینی 24 درصد از تغییرات مربوط به بین جمعیتها و 76 درصد مربوط به درون جمعیتها بود. درصد چندشکلی بهدست آمده از نشانگر پروتئینی 27 درصد، میانگین محتوای چندشکلی 01/0، میانگین شاخص اطلاعاتی شانون 49/0 و میانگین شاخص اطلاعاتی نی 68/0 بهدست آمد. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که سه مؤلفه اول 83 درصد از تغییرات را توجیه کردند. تجزیه خوشهای بر اساس ماتریس تشابه اکوتیپهای مورد مطالعه را در پنج خوشه گروهبندی نمود. گروهبندی اکوتیپها نشان داد که تنوع ژنتیکی از تنوع جغرافیایی تبعیّت نمیکند.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117967_68de00bef8e2ebb1769ef244b6ad7772.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Diallel analyses for dry forage yield among some alfalfa cultivarsتجزیه دیآلل برای عملکرد علوفه خشک بین برخی ارقام یونجه30231011797710.22092/ijrfpbgr.2018.117977FAایرج برنوسینویسنده مسئول، دانشیار، گروه اصـلاح و بیوتکنولـوژی گیاهی، دانشـکده کشـاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
پست الکترونیک: i.bernosi@urmia.ac.irعبدالله حسن زاده قورت تپهاستادیار، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعـی اسـتان آذربایجـانغربـی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، ارومیهJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.302.52.26.1578.1607
<br />The objective of this study was to develop population hybrids by crossing five alfalfa<br />cultivars of different geographic origin (Ghareh Yonjeh, Hamedani and Mahalie-Esfahan from<br />Iran, Elchi from Turkey and Ordobad from Azerbaijan) and assessment of combining ability<br />among them using diallel analysis. A half diallel was performed during 2012 between the<br />selected cultivars. For each pairwise cross, ten plants were chosen at random to obtain F1<br />generation. Heterotic responses were determined by evaluation forage yield of the cultivars and<br />their 10 half-diallel hybrids in seeded plots that were harvested three times in each of 2 years<br />(2014 and 2015). Variation among crosses was attributed primarily to general combining ability<br />(GCA) effects. However, specific combining ability (SCA) effects were also significant. Midparent<br /><br />heterosis ranged from 7.1% in the Elchi x Hamedani to -9.9 % in the Ghareh Yonjeh x<br />Mahalie-Esfahan and high-parent heterosis ranged from 3.4 % in the Elchi x Hamedani to 16.7%<br /><br />Ghareh Yonjeh x Mahalie-Esfahan. Results indicated that Elchi cultivar could be<br />considered as a member of a potential heterotic group for adapted cultivars (Ghareh Yonjeh and<br />Hamedani) to the studied environment. <br /><br />DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.302.52.26.1578.1607
<br /> هدف از این مطالعه، ایجاد هیبریدهای جمعیتی با تلاقیدادن پنج رقم یونجه از نواحی جغرافیایی مختلف (قره یونجه، همدانی و محلی اصفهان از ایران، الچی از ترکیه و اردوباد از آذربایجان) و بررسی میزان ترکیبپذیری بین آنها، با استفاده از تجزیه دیآلل بود. یک دیآلل یکطرفه در میان ارقام مورد نظر در سال 1391 اجرا شد. برای بهدست آوردن نسل F1 برای هر تلاقی دوتایی، 10 گیاه بهطور تصادفی از هر رقم انتخاب گردید. واکنشهای هتروتیک، با ارزیابی عملکرد گیاهان حاصل از کاشت بذرهای ارقام و 10 هیبرید حاصل از دیآلل یکطرفه آنها طی دو سال (1393 و 1394) با سه چین در هر سال تعیین شد. تغییرات عملکرد علوفه در میان تلاقیها عمدتاً به اثرات ترکیبپذیری عمومی (GCA) نسبت داده شد. بههرحال اثرات ترکیبپذیری خصوصی (SCA) نیز معنیدار بود. دامنه هتروزیس نسبت به میانگین والدین (MPH) از 1/7% در هیبرید الچی × همدانی تا 9/9-% در هیبرید قره یونجه × محلی اصفهان و هتروزیس والد برتر (HPH) از 4/3% در هیبرید الچی × همدانی تا 7/16-% در هیبرید قره یونجه × محلی اصفهان بود. رقم الچی میتواند بهعنوان عضوی از یک گروه هتروتیک بالقوه برای ارقام سازگار با منطقه (قره یونجه و همدانی) در نظر گرفته شود.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117977_7e9fbb117e4a5d4e9442a190dbc45686.pdfمؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشورتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران1735-089126220181222Evaluation of yield and quality traits of tolerant and semi tolerant populations to powdery mildew in sainfoin (Onobrychis viciaefolia)ارزیابی صفات کمی و کیفی جمعیتهای متحمل و نیمهمتحمل به بیماری سفیدک سطحی در اسپرس (Onobrychis viciaefolia)31132611798010.22092/ijrfpbgr.2018.117980FAمحمدعلی علیزاده*- نویسنده مسئول، دانشیار، گروه تحقیقات بانک ژن منابع طبیعی ایران، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران
پست الکترونیک: Alizadeh202003@gmail.comعلی اشرف جعفریاستاد، بخش تحقیقات مرتع، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهرانhttp://orcid.org/000سید اسماعیل سیدیانکارشناسان ارشد، گروه تحقیقات بانک ژن منابع طبیعی ایران، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهرانمحمود امیرخانیکارشناسان ارشد، گروه تحقیقات بانک ژن منابع طبیعی ایران، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهرانمحمدرضا پهلوانیکارشناسان ارشد، گروه تحقیقات بانک ژن منابع طبیعی ایران، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهرانلیلا فلاح حسینیکارشناسان ارشد، گروه تحقیقات بانک ژن منابع طبیعی ایران، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهرانمعصومه رمضانی یگانهکارشناسان ارشد، گروه تحقیقات بانک ژن منابع طبیعی ایران، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهرانJournal Article20181222DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.311.52.26.1575.41
<br />In order to identify tolerated populations of sainfoin to powdery mildew, seeds of ten<br />populations of Onobrychis viciaefolia, originated from different regions of Iran were sown in<br />Alborz research station during 2013. Tolerant and susceptible populations were cultivated in<br />natural condition and evaluated in terms of contamination and other parameters as yield and<br />quality traits. Result showed that two populations of 15353, 3001, Oshnaviaeh and Polycross<br />had disease severity index less than 25% and nominated as tolerant populations. The rest of<br />populations due to disease severity index between 25 to 50% and over than 50% were<br />considered as semi tolerant and susceptible, respectively. The tolerant (15353, 3001,<br />Oshnaviaeh and Polycross) populations had higher forage and seed yield than susceptible<br />populations. They showed also higher values of quality traits (Protein content, water soluble<br />carbohydrate, digestive material and ash content) than susceptible ones. In contrast the<br />susceptible populations had higher crude fiber, ADF and NDF compared with tolerant<br />populations. In principle component analysis (PCA), the first four components accounted for<br />83% of total variation. The first three components were known as yield, quality traits and<br />disease severity index, respectively. Result of cluster analysis showed that population of 3001,<br />15353, 9263, 4083 and Oshnaviaeh and Polycross were located in cluster 2 that<br />these popolations have lower mean values of disease severity index and higher forage and seed<br />production.DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.311.52.26.1575.41
<br /> بهمنظور شناسایی جمعیتهای متحمل به بیماری سفیدک سطحی در اسپرس زراعی (<em>Onobrychis viciaefolia</em>)، ده جمعیت با منشأ متفاوت در ایستگاه تحقیقاتی البرز، در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی در سه تکرار بهمدت دو سال (1393 و 94) کشت و ارزیابی شدند. جمعیتهای متحمل بهصورت طبیعی از لحاظ آلودگی به بیماری سفیدک سطحی و سایر پارامترها مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که جمعیتهای 15353 و 3001 و اشنویه و پلیکراس با داشتن شاخص شدت بیماری صفر تا 25 درصد بهعنوان متحمل و بقیه جمعیتها با داشتن شاخص شدت بیماری 25 تا 50 درصد و بین 50 تا 100 درصد بهعنوان جمعیتهای نیمهحساس و حساس به سفیدک ارزیابی شدند. جمعیتهای متحمل از لحاظ ماده خشک قابل هضم و کربوهیدراتهای محلول در آب دارای میانگین بیشتری نسبت به جمعیت حساس بودند ولی درصد پروتئین خام آنها در حد متوسط بود. جمعیتهای متحمل به سفیدک (3001، 15353، اشنویه و پلی کراس) بیشترین عملکرد علوفه و عملکرد بذر نسبت به جمعیتهای حساس را داشتند. در تجزیه به مؤلفههای اصلی 11 صفت مورد بررسی در 4 مؤلفه با مجموع واریانس توجیه شده 83 درصد قرار گرفتند. نتایج نشان داد مؤلفههای 1 تا 3 شامل مؤلفه عملکرد، مؤلفه کیفیت علوفه و مؤلفه شاخص شدت بیماری محسوب شدند. در تجزیه خوشهای جمعیتهای 3001، 9263،15353، 4083، اشنویه و پلیکراس در خوشه 2 قرار گرفتند که این جمعیتها دارای شاخص شدت بیماری عمدتا متحمل تا نیمهمتحمل و از لحاظ عملکرد علوفه پرمحصول بودند.https://ijrfpbgr.areeo.ac.ir/article_117980_3f5b958e2ae028d09b436a99d8c6cfb7.pdf